A concessão das linhas 11-Coral, 12-Safira e 13-Jade trará melhorias importantes para algumas estações. Em Guaianases haverá a unificação das plataformas e novas escadas rolantes.
O Empreendimento EST 009 – Reforma da Estação Guaianases deverá promover uma série de ações para melhorar o fluxo de passageiros e as futuras mudanças operacionais.
Atualmente a Estação Guaianases tem área de 23,5 mil m² com demanda estimada em 72,4 mil passageiros por dia.

Melhorias
Dentre as principais melhorias no ambiente externo estão adequações para acessibilidade como rebaixamento de guias, pintura de faixas para pedestres, e ampliação de baias para ônibus.
Um novo bicicletário deverá ser implantado na estação permitindo assim a intermodalidade.
O acesso central da estação deverá ganhar um novo elevador, permitindo a entrada dos passageiros que possuam alguma restrição de mobilidade.
Nos ambientes internos estão previstas uma série de mudanças. A SSO deverá ser deslocada de local para que seja realizada a ampliação da linha de bloqueios que contará com mais acessos, incluindo aqueles com acessibilidade.
Dentro da estação serão removidas as rampas, sendo trocadas por escadas fixas. Quatro novas escadas rolantes serão implantadas na estação em substituição às escadas fixas existentes.
Para permitir a acessibilidade dos passageiros serão implantados dois novos elevadores.

No futuro também está prevista a unificação das plataformas em uma unica área de embarque com 19,5 metros de largura. A via central será removida.
No futuro o serviço Expresso Leste deverá ser estendido até Suzano com redução de intervalos, desta forma a Estação Guaianases será atendida por apenas duas plataformas de maior dimensão.
A estação deverá receber melhorias internas para os funcionários, reparos pontuais em sistemas e infraestrutura e adequação das rotas táteis. A comunicação visual será adequada aos padrões mais atuais.

A concessão das linhas 11, 12 e 13 tem previsão para ser realizada no primeiro trimestre de 2025. Confira também as matérias das demais estações: